AlphaFold rješava enigme ćelijskih molekularnih struktura




Na slici se nalazi model kompleksa pore nukleusa ćelije, strukture koja dozvoljava da iz nukleusa izađe RNK. To je najveća molekularna mašina u našim ćelijama. Ove pore prolaze kroz membranu nukelusa, povezujući ga s citoplazmom.

Više od decenije molekularni biolozi pokušavaju sastaviti model ovog proteina, koji kontroliše protok molekula u i iz nukelus stanice, gdje se nalazi genom, odnosno cjelokupna DNK ćelije.

Stotine i hiljade ovih kompleksa postoje u svakoj stanici. Svaki se sastoji od više od 1000 proteina koji zajedno tvore prstenove oko pore kroz nuklearnu membranu. Ovih 1000 dijelova slagalice izvučeno je iz više od 30 proteinskih građevnih blokova koji se isprepliću na bezbroj načina.

Godine 2016. tim predvođen Martinom Beckom s Instituta za biofiziku Max Planck u Frankfurtu izvijestio je o modelu koji je pokrivao oko 30% kompleksa nuklearnih pora i oko polovice od 30 građevnih blokova, nazvanih Nup proteini.

Zatim, prošlog jula, londonska kompanija DeepMind, dio Alphabeta - Googleove matične tvrtke - objavila je AI alat pod nazivom AlphaFold. Softver bi mogao predvidjeti 3D oblik proteina iz njihovog genetičkog slijeda s velikom preciznošću. Ovaj softver je pomogao i u dešifrovanju nuklearnog kompleksa. 

Primjedbe

Popularni postovi s ovog bloga

Klitoris: vrh ledenog brijega užitka

Ne, nije tačno da potpuno vakcinisani zdravstveni radnici imaju 251 puta veće virusno opterećenje i da su opasnost za nevakcinisane

Soda bikarbona i "alkalna prehrana" - opasni mitovi koji ne umiru