Quantum of Science

Ukoliko sumnjate da ste inficirani   koronavirusom SARS-CoV-2 i imate COVID-19, možete uraditi brzi antigenski test (BAT, na engleskom lateral flow test – LFT, rapid antigen test - RAT) ili PCR test. Međutim, koji je bolji, koji je precizniji? Ljudi se često odlučuju na brze antigenske, jer su jeftiniji i mnogo pristupačniji, pošto se sada mogu nabaviti i u apetokama. U slučaju da im ovaj test bude pozitivan, ljudi idu i na PCR testiranje. Ali, koliko dobro ovi testovi detektuju omikron varijantu?   Kako se razlikuju brzi antigenski test (BAT) i PCR? I brzi antigenski test test i PCR (preciznije, qRT-PCR koji se koristi za RNK viruse) koriste briseve, neki BAT u uputstvu navode da bris treba biti i nosnica i ždrijela, a i kod PCR se u nekim slučajevima uzima ili samo bris iz nosa ili i nos i ždrijelo. Koronavirus ima tendenciju da se povuče iz nosa nešto kasnije u donje dijelove dišnih puteva, pa se, ako je prošlo više dana od pojave simptoma radi se i bris ždrijela. A...

PCR (pi-si-ar, prema pravilima spelovanja u engleskom jeziku) je akronim za Polymerase Chain Reaction, odnosno lančanu reakciju polimeraze, proceduru koju je 1983. razvio nobelovac Kary Mullis. Ovom metodom naučnici povećavaju broj – vrše amplifikaciju – određenih segmenata nukleinskih kiselina, odnosno nasljednog materijala. Originalno, PCR je bio metoda amplifikacije segmenata DNK, a kasnije je razvijena i inačica koja amplificira RNK. Svrha PCR-a jeste da se stvori dovoljno genetičke sekvence koja bi se mogla detektovati i analizirati. O samom PCR-u  i kako se on radi pisala sam u tekstu "PCR: boldiranje DNK". Međutim, šta ako trebamo amplificirati RNK, recimo ako tražimo neki RNK virus, kojima ima isključivo ovu molekulu kao "urnek" za sintezu svojih komponenti? Naime, obje ove molekule – i DNK i RNK – predstavljaju nasljedni materijal, s određenim razlikama u strukturi. Obično se DNK sastoji od dva lanca koji imaju različite smjerove i uvijeni su u...

Šta pokazuje PCR test na COVID-19 tj. na virus koji izaziva ovu infekciju? PCR test je test kojim detektujemo prisustvo virusnog genetičkog materijala. U slučaju virusa SARS-CoV-2, to su sekvence ribonukleinske kiseline - RNK. Virusi mogu sadržavati samo ili DNK (recimo, virusa herpesa) ili sa RNK - nikako obje molekule, dok naše ćelije i ćelije drugih živih bića (bakterije, gljive, biljke, životinje) sadrže i RNK i DNK. Virusi nisu živa bića - to su infektivne čestice, infektivni entiteti koji nemaju samostalan metabolizam i ne mogu se samostalno replicirati tj. umnožavati. Za to im je potreban neki domaćin. Virusi "kidnapuju" nasljedni materijala domaćina i natjeraju ga da umjesto svojih proteina proizvodi komponente virusa.  PCR test pokazuje da li trenutno imate aktivnu infekciju , ali je potrebno da se dovoljno virusa replicira u vašim disajnim organima, da bi se mogao detektovati. To znači da ne možemo pokazati infekciju u ranim fazama inkubaci...

" Malo poznato ali PCR aparat je ustvari ringla sa tajmerom na sebi.", Imer Muhović, Twitter Ima tih nekih stvari što se po školama ne uče, a, kako čujem, ostaju na vrlo opskurnom nivou razumijevanja i onima koji studiraju biologiju.  PCR Vi koji ste pratili C.S.I. (ok, ta serija sad već prilično demode) ili Bones (ok, i ova serija je prošlost), možda ste naletili na termin PCR. Puno stvari u genetici zvuče čudno i nejasno, mnogo postupaka i tehnika djeluju kao magija, a PCR je jedna od tih tehnika čiji su principi tako razumljivi ljudima iz branše, a tako čudni svima ostalim. PCR je termin koji se odnosi na tehniku umnožavanja DNK. Da vas podsjetim - DNK je neobična molekula sa mnogo neobičnih svojstava, a jedno od njih je da DNK može proizvesti samu sebe u procesu koji se naziva autoreplikacija /duplikacija. DNK se duplicira u S-fazi staničnog ciklusa i nakon duplikacije DNK hromosomi dobijaju dvije hromatide. Također, DNK funkcioniše kao neka vrsta otis...