Postovi

Prikazivanje postova s oznakom RNK

Alternativni splicing (splajsing): kako 100 000 proteina od 20 000 gena?

Slika
Postoji jedno vrlo interesantno pitanje. Ljudski genom (cjelokupna DNK u jednoj stanici) sadrži oko 20 000 gena, ali genom proizvodi oko 100 000 različitih proteina. Upravo stoga su naučnici, kada je rađen Human Genom Project, predviđali kako bi ljudski genom trebao sadržavati oko 100 000 gena. Čak su se organizovala i klađenja ko će pogoditi broj gena. A onda - ka-bum! - ispostavilo se da genom naše vrste ima manje od 20 000 gena. Ako je je gen šifra za protein, kako onda da 3/4 proteina nema svoju šifru u DNK? Ovo je jasno mojim kolegama, biolozima, ali objasniti bilo kome drugom, nekome ko ima samo malo predznanja iz oblasti genetike (pod tim podrazumijevam da je čuo/čula za pojmove gen, hromosom, DNK, protein) je jako težak zadatak. Naime, bojim se da ću u pokušaju da pojednostavim i ne zbunim novim informacijama preskočiti neke stvari te time stvoriti "rupu" u objašnjenju. Kao kad gledate krimić, pa onda odete u WC, u međuvremenu se nešto dogodilo i sad v...

RNK interferencija i terapeutske mogućnosti ovog mehanizma

Slika
RNK interferencija je moderni naziv za pojavu da male sekvence RNK sprječavaju translaciju genetičkog koda u protein. Ta inhibicija ekspresije gena se događa djelovanjem na određenu sekvencu informacione RNK (iRNK, eng. messenger RNA , mRNA). U prirodi, ovaj mehanizam najčešće predstavlja mehanizam odbrane od virusa i transposona (transpozona), ali ima i utjecaja u dirigovanju procesa razvoja. Međutim, naučnici su rano shvatili da se ovaj mehanizam može iskoristiti i u biotehnologiji te biomedicini. Ovaj fenomen je nekada nosio  naziv post-transkripcijsko utišavanja i quelling . Za otkriće RNK interferencije i mehanizama putem kojih se ona događa Andrew Fire i Craig C. Mello su 2006. dobili Nobelovu nagradu za medicinu ili fiziologiju. Oni su proučavali sve ovo na jednom neuglednom, ali za genetiku izuzetno važnom organizmu, nematodi  Caenorhabditis elegans. Caenorabditis elegans, By  Kbradnam at English Wikipedia(Original text: Zeynep F. Altun, Editor ...

Koja je funkcija RNK i koji su glavni tipovi RNK?

Slika
Created in Biorender RNK (Er-en-ka) je skraćenica za r ibo n ukleinsku k iselinu , molekulu srodnu molekuli dezoksiribonukleinske kiseline. Na engleskom je naziv za ovu kompleksnu molekulu r ibo n ucleic a cid , pa prema tome, akronim/skraćenica za ovu molekulu na engleskom glasi RNA (čitati:ar-en-ei).  RNK je, kao i DNK, nukleinska kiselina. Po nekim stvarima je slična DNK, ali se ove dvije molekule u mnogim bitnim stvarima razlikuju. Objesu biološke makroolekule, odnosno, to znači da su polimeri, jer se sastoje iz velikog broja jedinica (nukleotida) i da imaju veliku molekularnu masu. DNK je dvostruki lanac, dok je RNK jednostruki lanac, osim izuzetno, jer postoje i dvolančane molekule RNK, ali to su posebni slučajevi. Zatim, RNK sadrži petougljični šećer ribozu , po kojem  je i dobila ima, a ne dezoksiribozu, kao DNK. DNK sadrži azotne baze adenin, timin, gvanin i citozin, dok kod RNK ne postoji timin, nego je on zamijenjen bazom uracil . Dakle, la...

Mali rječnik genetike, drugi dio

Slika
(Ovaj kratki rječnik nije nastao sa intencijom da to bude stručni rječnik svih pojmova iz genetike, nego je namijenjen učenicima i laicima te su stoga pojmovi objašnjeni što je moguće jednostavnije)  Kloniranje: metoda manipulacije genetičkim materijalom u cilju dobijanja genetički istovjetnih jedinki. Jedinke koje imaju istovjetan genetički materijal se nazivaju klonovima.  Mitohondrijalna DNK (mDNK):  mitohondrijalna i hloroplastna DNK su zasebne molekule u genomu viših organizama, onih čije stanice imaju organele. Prema teoriji endosimbioze, mitohondrije i hloroplasti su nastali od bakterija, koje je neka stanica progutala. DNK koja se nalazi u ovim organelama stanice ima više sličnosti sa bakterijskom DNK - cirkularna je, a geni su kontinuirani (nema introna). Međutim, i na ovoj DNK se nekada mogu dogoditi mutacije koje izazivaju ozbiljne poremećaje metabolizma. Mi nasljeđujemo svu svoju mitohondrijalnu DNK od majke, jer spermatozioidi pri oplodnji svo...

Epigenetika RNK

Slika
Do sada se mislilo da se samo na DNK pojavljuju epigenetičke promjene. Međutim, nova studija koju su radili naučnici sa University of Chichago i Tel Aviv University, objavljena u časopisu Nature ovog februara, pokazala je kako zapravo RNK ima centralnu ulogu u epigenetičkoj regulaciji.  Svjesna sam toga da ljudi koji nisu iz branše ne razumiju baš tačno šta je to DNK, a šta RNK, pa ću samo nakratko skrenuti u jedno vrlo kratko i površno objašnjenje - DNK je ona velika molekula u obliku dvostruke spirale koja čini hromosome i nalazi se isključivo u jedru stnaice. Da bi DNK, koja nikad ne izlazi iz jedra, mogla dirigovati sintezu bjelančevina, mora postojati neki medijator, "glasnik" između nje i aminokiselina koje grade bjelančevina. Taj medijator je nešto manja molekula RNK, koja ima oblik jednostruke spirale. RNK se prepiše sa DNK, ide van jedra, na organelama zvanim ribosomi "čeka" jednu drugu vrstu RNK, koja nosi aminokiselinu, te dvije RNK se spoj...