Novi način editovanja genoma: pAgo

(Credit: Pat Kinsella)
CRISPR-Cas 9 je trenutno najomiljenija tehnika editovanja genoma, a već ima svog nasljednika, prime editing. Prije koju godinu, pojavilo se još nešto, pAgo, što je akronim od Prokaryotic Argonaute proteins, što bi također mogla biti alternativa CRISPR-u.

pAgo proteini su argonaut proteini koji utišavaju RNK, odnosno izmjenjuju aktivnost gena preko interferencije. Također, kao i CRISPR, predstavljaju odbrambeni sistem bakterija - prokariota, od virusne DNK. Treba napomenuti da se ne nalaze samo kod bakterija - oni su veoma očuvana porodica gena i proteina koje oni kodiraju, a naziv su dobili po tome što strukturalno liče na pelagijskog oktopoda, Argonauta argo. Radi se o porodici proteina koji koriste  male RNK vodiče koje regulišu ekspresiju gena preko ciljanih odgovarajući mRNK molekula (mRNK su kodirajuće RNK molekule, one uključene u transkripciju i translaciju). 

Međutim, kod nekih bakterija prokariotski Argonaut proteini koriste DNK vodiče. Ukratko - većina ovih proteina koristi RNK vodiče, ali kod bakterija postoje i neki koji koriste molekulu DNK. Bakterijama je zapravo važnije da se mogu odbraniti od invazivne strane RNK, jer više virusa su zapravo RNK virusi, tj. sadrže samo molekulu RNK kao genetički materijal (ponovimo - virusi mogu imati samo DNK ili RNK).

Ako postoji potpuna ili gotovo potpuna komplementarnost sekvence između male RNK i cilja, Argonaut protein komponenta kompleksa koji naučnici zovu RNK-inducirajući utišavajući kompleks (RNA-induced silencing complex - RISC) posreduje u cijepanju ciljanog transkripta,a  mehanizam uključuje pretežno represiju procesa translacije. 

Drugim riječima, Argonaut komponenta potiskuje sam proces sinteze produkta gena, tj. ekspresiju gena. Zapravo, tako bi smo mogli potisnuti ekspresiju onih varijanti gena koje  sintetiziraju neki "falični" protein. 

Primjedbe

Objavi komentar

Popularni tekstovi

Kreacionizmi i inteligentni dizajn: infantilni pristup nauci kao "rješenje" za sva pitanja čovječanstva

Slika
Da, bila sam na predavanjima Tomislava Terzina koja je prošle sedmice održao u Sarajevu. Smatram da je biti na predavanju nekoga ko zastupa poziciju kreacionizma ili inteligentnog dizajna kulturološki kuriozitet te da svako ko se ozbiljno bavi pisanjem o nauci mora vidjeti i to čudo jer jednostavno, morate vidjeti sa čim se suočavate, a ne na slijepo konstatovati stavove ljudi koji imaju ovakvu poziciju. Naime, ima mnogo kreacionizama i inteligentih dizajna i glup je potez jedne optuživati za ideje koje brane druge frakcije.  Dakle, prvo malo o Terzinu. Kao prvo nije nimalo nesimpatičan - blag je, pastozan, mogao bi biti sjajan pop. Ako ga zamišljate kao ekscentrika a la Semir ili da je nekakav  psycho - razočaraću vas. Kada priča o genetici, strukturi DNK, restriktivnim enzimima, rekombinatnoj DNK, predavanja su mu tačna, jasna i bez nekih prevelikih pojednostavljenja. Ipak, čovjek je molekularni biolog. Zanimljivo je da je on više na strani inteligentnog dizajn...
Pročitajte više

Frka oko Jablaničkog jezera

Slika
Jablaničko jezero trenutno, izvor: Al Jazeera Balkans Pošto vidim da su svi bijesni sa ovim oko Jablaničkog jezera: jeste, ružna je slika. Međutim, koliko ja shvatam i koliko sam se raspitivala kod ljudi su na jezeru, Elektroprivreda i uprava akumulacije su morale to uraditi da ne bi došlo do presušivanja u donjim tokovima, Akumulacija je vlasništvo Elektroprivrede i nije prirodni ekosistem. Pustinja koju ste vidjeli na uskukalim snimcima Al Jazeere će se obnoviti uz malo sreće, ako bude snijega i kiša. Nemojte previše plakati za populacijom smuđa - to nije riba koja pripada slivu Neretve. Unesen je u Jablaničkom početkom osamdesetih, a to su uradili nesavjesni ribari. Ispalo je da je smuđ kompeticija autohtonoj i endemičnoj neretvanskoj mekousnoj pastrmci koja je potisnuta. Ipak, ribolovci su uporno nastavljali poribljavanje smuđem. Nažalost, nakon ovoga, populacija smuđa je uništena, kao i drugih riba, a kako je smuđ, pored šarana, postao praktično jedina riba u jezeru, t...
Pročitajte više