Test na novi koronavirus zasnovan na CRISPR daje rezultate za 5 minuta

 

Izvor slike: Euronews

Tehnologija CRISPR koja služi za uređivanje genoma i izrezivanje gena, a koja je bila zvijezda ovogodišnjih objava imena dobitnika Nobelovih nagrada, temelj je novog testa na koronavirus za koji je potrebno svega 5 minuta.

Jennifer Doudna i Emmanuelle Charpentier su dvije naučnice koje će ove godine podijeliti Nobelovu nagradu za hemiju. Njihovo otkriće da se pomoću malih sekvenci nukleinskih kiselina enzim iz porodice Cas enzima, koji siječe DNK na tačno određenom mjestu može koristiti kao „molekularne makaze“ u svega osam godina je unaprijedilo područje biomedicine brzinom koju je teško uporediti sa bilo čime drugim. Osim za uređivanje genoma, ova tehnologija se počinje koristiti i za jedan od gorućih problema čovječanstva danas: pandemiju COVID-19 i njenu kontrolu.

CRISPR dijagnostika je jedan od puteva ubrzavanja testiranja i poboljšanja kontrole pandemije. Za novi tip testova neće biti potrebna skupa oprema, a trajaće oko 5 minuta.

CRISPR testovi rade identificiranje slijeda RNK koji je dug ok oko 20 baza RNK i koji je jedinstven za SARS-CoV-2. To čine stvaranjem RNK "vodiča" koja je komplementarna ciljnoj sekvenci RNK i, tako će se vezati za nju u otopini. Kad se vodič veže za cilj, enzim Cas13 koji je u ovom slučaju „molekularne makaze“ alata CRISPR uključuje se i odsijeca bilo koju obližnju jednolančanu RNK. Ovi rezovi oslobađaju fluorescentnu česticu u otopinu za ispitivanje. Kada se uzorak zatim ispituje svjetlošću, oslobođene fluorescentne čestice zasvijetle, signalizirajući prisutnost virusa.

Novi test će moći i kvantificirati količinu virusa u uzorku.

Rad o ovoj novoj metodi testiranja je objavljen na pre-print platformi MedRxiv pod naslovom „Directdetection of SARS-CoV-2 using CRISPR-Cas13a and a mobile phone“, a jedan od koautora je i Jennifer Doudna.

Još o razvoju CRISPR testova na SARS-CoV-2 sam pisala i ovdje.