Geni za rezistenciju na antibiotike skrivaju se i u bakterijama koje naseljavaju crijeva dojenčadi

A sada, ne baš lijepe vijesti:  stotine gena za rezistenciju na antibiotike nalaze se u bakterijama koje žive u crijevima dojenčadi. Uzimanje  antibiotika tokom kasne trudnoće utječe na takve gene u mikrobiomu dojenčeta.

U ljudskim crijevima žive milijarde i milijarde bakterija, a mnoge od njih imaju i gene koji im pomažu u borbi protiv antibiotika te ih čine rezistentnim na antibiotike. Ove grupe gena, kao i način na koji se nasljeđuju i prepisuju nazivamo "rezistom". Inače, ovo je pojam koji se koristi za dva potpuno drugačija koncepta - gene koji omogućavaju rezistenciju na antibiotike kod bakterija, ali i geni organizma koji mu omogućavaju da bude otporniji na viruse i bakterije. I ova dva rezistoma ne teba miješati.

Vratimo se početku priče - mikrobiomu dojenčadi.

Kako bi istražio kako rezistencija na antibiotike nastaje kod bakterija koje borave u nekoj osobi, Søren Sørensen s Univerziteta u Kopenhagenu i njegov tim analizirali su uzorke stolice 662 jednogodišnjaka iz Danske. Rad su objavili u Cell Host Microbiology u aprilu 2021. pod naslovom "The infant gut resistome associates with E. coli, environmental exposures, gut microbiome maturity, and asthma-associated bacterial composition".

Tim je pronašao 409 tipova gena koji daju rezistenciju na 34 klase antibiotika. Od tih tipova gena, 167 je pružalo rezistenciju na više antibiotika, uključujući kritično važne lijekove koje dojenčad nisu uzimala (ali bi ih mogla uzimati kasnije u životu). Stvar je u tome što bi bakterije koje nekoga zaraze mogle od ovih već postojećih bakterija koje imaju gene za otpornost na antibiotike, mogle dobiti ove osobine. 

Na sastav mješavine gena za rezistenciju na antibiotike utjecali su faktori okoliša, poput toga jesu li djeca odrasla u ruralnim ili urbanim područjima ili da li imaju stariju braću i sestre. Korištenje antibiotika tokom trudnoće 40 dana ili manje prije poroda također je imalo ulogu, kao i to da li je dijete rođeo prirodnim putem ili na carski rez

Viša razina gena otpornih na antibiotike povezana je s određenim sastavom crijevnih mikroba koje je tim prethodno povezao s povišenim rizikom od astme u kasnijem životu.